Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PrkcaP20444 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkcaP20444 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PrkcaP20444 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PrkcaP20444 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcaP20444 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PrkcaP20444 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PrkcaP20444 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcaP20444 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcaP20444 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PrkcaP20444 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PrkcaP20444 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcaP20444 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PrkcaP20444 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcaP20444 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PrkcaP20444 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PrkcaP20444 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcaP20444 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PrkcaP20444 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PrkcaP20444 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcaP20444 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PrkcaP20444 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcaP20444 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PrkcaP20444 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrkcaP20444 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcaP20444 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcaP20444 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrkcaP20444 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PrkcaP20444 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcaP20444 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PrkcaP20444 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcaP20444 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcaP20444 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PrkcaP20444 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcaP20444 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcaP20444 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PrkcaP20444 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PrkcaP20444 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PrkcaP20444 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcaP20444 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PrkcaP20444 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PrkcaP20444 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PrkcaP20444 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PrkcaP20444 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcaP20444 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrkcaP20444 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcaP20444 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcaP20444 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcaP20444 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrkcaP20444 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcaP20444 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcaP20444 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrkcaP20444 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcaP20444 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrkcaP20444 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkcaP20444 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcaP20444 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcaP20444 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcaP20444 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcaP20444 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcaP20444 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcaP20444 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcaP20444 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcaP20444 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcaP20444 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcaP20444 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PrkcaP20444 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcaP20444 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PrkcaP20444 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PrkcaP20444 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcaP20444 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcaP20444 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PrkcaP20444 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PrkcaP20444 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PrkcaP20444 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcaP20444 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PrkcaP20444 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms