Protein–RNA interactions for Protein: P19221

F2, Prothrombin, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P19221 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F2P19221 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
F2P19221 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
F2P19221 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
F2P19221 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
F2P19221 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
F2P19221 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
F2P19221 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
F2P19221 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F2P19221 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
F2P19221 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
F2P19221 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
F2P19221 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
F2P19221 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
F2P19221 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
F2P19221 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F2P19221 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F2P19221 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
F2P19221 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
F2P19221 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P19221 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
F2P19221 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P19221 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P19221 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P19221 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
F2P19221 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
F2P19221 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P19221 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
F2P19221 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
F2P19221 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
F2P19221 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P19221 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
F2P19221 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
F2P19221 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P19221 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
F2P19221 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
F2P19221 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
F2P19221 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
F2P19221 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
F2P19221 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
F2P19221 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
F2P19221 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
F2P19221 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
F2P19221 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
F2P19221 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
F2P19221 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P19221 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P19221 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P19221 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
F2P19221 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
F2P19221 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P19221 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
F2P19221 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F2P19221 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
F2P19221 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
F2P19221 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P19221 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P19221 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
F2P19221 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P19221 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
F2P19221 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
F2P19221 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
F2P19221 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
F2P19221 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
F2P19221 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
F2P19221 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
F2P19221 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F2P19221 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
F2P19221 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
F2P19221 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
F2P19221 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
F2P19221 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
F2P19221 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
F2P19221 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P19221 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
F2P19221 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
F2P19221 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
F2P19221 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
F2P19221 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P19221 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
F2P19221 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
F2P19221 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
F2P19221 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P19221 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P19221 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
F2P19221 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
F2P19221 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F2P19221 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
F2P19221 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P19221 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
F2P19221 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
F2P19221 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
F2P19221 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
F2P19221 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
F2P19221 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
F2P19221 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P19221 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
F2P19221 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P19221 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
F2P19221 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228 ms