Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxb1P17919 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxb1P17919 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb1P17919 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxb1P17919 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxb1P17919 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxb1P17919 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb1P17919 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxb1P17919 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxb1P17919 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxb1P17919 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxb1P17919 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb1P17919 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb1P17919 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb1P17919 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb1P17919 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb1P17919 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb1P17919 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb1P17919 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb1P17919 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb1P17919 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb1P17919 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb1P17919 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Hoxb1P17919 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hoxb1P17919 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb1P17919 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb1P17919 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hoxb1P17919 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb1P17919 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb1P17919 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxb1P17919 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxb1P17919 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Hoxb1P17919 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb1P17919 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb1P17919 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Hoxb1P17919 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb1P17919 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Hoxb1P17919 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Hoxb1P17919 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb1P17919 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxb1P17919 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb1P17919 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb1P17919 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxb1P17919 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxb1P17919 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb1P17919 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb1P17919 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxb1P17919 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxb1P17919 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxb1P17919 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxb1P17919 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb1P17919 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxb1P17919 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb1P17919 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxb1P17919 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxb1P17919 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb1P17919 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxb1P17919 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb1P17919 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxb1P17919 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxb1P17919 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb1P17919 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb1P17919 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxb1P17919 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb1P17919 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxb1P17919 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb1P17919 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb1P17919 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxb1P17919 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxb1P17919 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb1P17919 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb1P17919 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb1P17919 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxb1P17919 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxb1P17919 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb1P17919 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxb1P17919 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hoxb1P17919 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms