Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PcnaP17918 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PcnaP17918 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PcnaP17918 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PcnaP17918 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PcnaP17918 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PcnaP17918 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PcnaP17918 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PcnaP17918 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PcnaP17918 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PcnaP17918 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PcnaP17918 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PcnaP17918 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PcnaP17918 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PcnaP17918 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PcnaP17918 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PcnaP17918 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PcnaP17918 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PcnaP17918 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PcnaP17918 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PcnaP17918 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PcnaP17918 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PcnaP17918 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PcnaP17918 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PcnaP17918 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PcnaP17918 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PcnaP17918 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PcnaP17918 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PcnaP17918 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PcnaP17918 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PcnaP17918 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PcnaP17918 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PcnaP17918 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PcnaP17918 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PcnaP17918 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PcnaP17918 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PcnaP17918 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PcnaP17918 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PcnaP17918 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PcnaP17918 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PcnaP17918 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PcnaP17918 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PcnaP17918 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PcnaP17918 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PcnaP17918 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PcnaP17918 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PcnaP17918 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PcnaP17918 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PcnaP17918 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PcnaP17918 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PcnaP17918 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PcnaP17918 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PcnaP17918 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PcnaP17918 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PcnaP17918 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PcnaP17918 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PcnaP17918 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PcnaP17918 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PcnaP17918 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PcnaP17918 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PcnaP17918 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PcnaP17918 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PcnaP17918 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PcnaP17918 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PcnaP17918 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PcnaP17918 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PcnaP17918 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PcnaP17918 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PcnaP17918 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PcnaP17918 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PcnaP17918 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PcnaP17918 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PcnaP17918 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PcnaP17918 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PcnaP17918 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PcnaP17918 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PcnaP17918 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PcnaP17918 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PcnaP17918 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PcnaP17918 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PcnaP17918 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PcnaP17918 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PcnaP17918 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PcnaP17918 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PcnaP17918 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PcnaP17918 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PcnaP17918 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PcnaP17918 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PcnaP17918 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
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