Protein–RNA interactions for Protein: P17439

Gba, Glucosylceramidase, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GbaP17439 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GbaP17439 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GbaP17439 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GbaP17439 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GbaP17439 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GbaP17439 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GbaP17439 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GbaP17439 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GbaP17439 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GbaP17439 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GbaP17439 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GbaP17439 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GbaP17439 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GbaP17439 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GbaP17439 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GbaP17439 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GbaP17439 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GbaP17439 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GbaP17439 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GbaP17439 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GbaP17439 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GbaP17439 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GbaP17439 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GbaP17439 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GbaP17439 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GbaP17439 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GbaP17439 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GbaP17439 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GbaP17439 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GbaP17439 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GbaP17439 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GbaP17439 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GbaP17439 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GbaP17439 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GbaP17439 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GbaP17439 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GbaP17439 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GbaP17439 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GbaP17439 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GbaP17439 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GbaP17439 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GbaP17439 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GbaP17439 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GbaP17439 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GbaP17439 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GbaP17439 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GbaP17439 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GbaP17439 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GbaP17439 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GbaP17439 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GbaP17439 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GbaP17439 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GbaP17439 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GbaP17439 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GbaP17439 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GbaP17439 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GbaP17439 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GbaP17439 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GbaP17439 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GbaP17439 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GbaP17439 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GbaP17439 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GbaP17439 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GbaP17439 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GbaP17439 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.33■■□□□ 1
GbaP17439 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GbaP17439 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GbaP17439 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GbaP17439 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GbaP17439 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GbaP17439 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GbaP17439 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GbaP17439 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GbaP17439 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GbaP17439 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GbaP17439 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GbaP17439 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GbaP17439 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GbaP17439 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GbaP17439 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GbaP17439 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GbaP17439 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GbaP17439 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GbaP17439 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GbaP17439 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GbaP17439 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GbaP17439 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GbaP17439 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GbaP17439 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GbaP17439 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GbaP17439 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GbaP17439 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GbaP17439 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GbaP17439 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GbaP17439 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GbaP17439 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GbaP17439 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GbaP17439 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GbaP17439 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GbaP17439 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms