Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nr4a1P12813 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr4a1P12813 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nr4a1P12813 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nr4a1P12813 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr4a1P12813 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nr4a1P12813 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr4a1P12813 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr4a1P12813 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr4a1P12813 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr4a1P12813 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr4a1P12813 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr4a1P12813 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr4a1P12813 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr4a1P12813 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr4a1P12813 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr4a1P12813 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr4a1P12813 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr4a1P12813 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Nr4a1P12813 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr4a1P12813 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr4a1P12813 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr4a1P12813 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr4a1P12813 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nr4a1P12813 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nr4a1P12813 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nr4a1P12813 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr4a1P12813 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr4a1P12813 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr4a1P12813 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nr4a1P12813 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr4a1P12813 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr4a1P12813 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr4a1P12813 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nr4a1P12813 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Nr4a1P12813 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr4a1P12813 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nr4a1P12813 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr4a1P12813 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nr4a1P12813 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nr4a1P12813 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nr4a1P12813 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nr4a1P12813 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr4a1P12813 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr4a1P12813 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nr4a1P12813 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Nr4a1P12813 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr4a1P12813 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Nr4a1P12813 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Nr4a1P12813 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Nr4a1P12813 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Nr4a1P12813 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Nr4a1P12813 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Nr4a1P12813 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr4a1P12813 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Nr4a1P12813 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nr4a1P12813 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nr4a1P12813 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nr4a1P12813 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr4a1P12813 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr4a1P12813 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr4a1P12813 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr4a1P12813 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nr4a1P12813 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr4a1P12813 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr4a1P12813 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nr4a1P12813 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr4a1P12813 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nr4a1P12813 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nr4a1P12813 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nr4a1P12813 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nr4a1P12813 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nr4a1P12813 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nr4a1P12813 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr4a1P12813 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr4a1P12813 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nr4a1P12813 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nr4a1P12813 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr4a1P12813 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr4a1P12813 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nr4a1P12813 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr4a1P12813 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nr4a1P12813 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nr4a1P12813 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nr4a1P12813 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nr4a1P12813 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nr4a1P12813 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms