Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Prf1P10820 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Prf1P10820 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prf1P10820 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Prf1P10820 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Prf1P10820 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Prf1P10820 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Prf1P10820 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prf1P10820 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Prf1P10820 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Prf1P10820 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Prf1P10820 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Prf1P10820 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Prf1P10820 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Prf1P10820 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prf1P10820 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prf1P10820 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Prf1P10820 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prf1P10820 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Prf1P10820 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prf1P10820 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Prf1P10820 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Prf1P10820 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prf1P10820 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prf1P10820 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Prf1P10820 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prf1P10820 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prf1P10820 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prf1P10820 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Prf1P10820 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Prf1P10820 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Prf1P10820 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Prf1P10820 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prf1P10820 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Prf1P10820 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prf1P10820 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Prf1P10820 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Prf1P10820 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Prf1P10820 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Prf1P10820 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Prf1P10820 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prf1P10820 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Prf1P10820 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Prf1P10820 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prf1P10820 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prf1P10820 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prf1P10820 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Prf1P10820 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Prf1P10820 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Prf1P10820 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prf1P10820 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prf1P10820 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Prf1P10820 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prf1P10820 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Prf1P10820 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prf1P10820 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prf1P10820 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Prf1P10820 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Prf1P10820 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Prf1P10820 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Prf1P10820 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Prf1P10820 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Prf1P10820 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Prf1P10820 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Prf1P10820 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Prf1P10820 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Prf1P10820 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Prf1P10820 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Prf1P10820 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Prf1P10820 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Prf1P10820 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Prf1P10820 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Prf1P10820 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Prf1P10820 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Prf1P10820 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Prf1P10820 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Prf1P10820 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prf1P10820 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Prf1P10820 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prf1P10820 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Prf1P10820 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Prf1P10820 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Prf1P10820 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prf1P10820 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Prf1P10820 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Prf1P10820 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prf1P10820 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prf1P10820 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Prf1P10820 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms