Protein–RNA interactions for Protein: P0C673

Igsf11, Immunoglobulin superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf11P0C673 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Igsf11P0C673 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Igsf11P0C673 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Igsf11P0C673 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Igsf11P0C673 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Igsf11P0C673 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Igsf11P0C673 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Igsf11P0C673 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Igsf11P0C673 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Igsf11P0C673 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Igsf11P0C673 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Igsf11P0C673 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Igsf11P0C673 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Igsf11P0C673 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Igsf11P0C673 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Igsf11P0C673 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Igsf11P0C673 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Igsf11P0C673 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Igsf11P0C673 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Igsf11P0C673 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Igsf11P0C673 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Igsf11P0C673 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Igsf11P0C673 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Igsf11P0C673 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Igsf11P0C673 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Igsf11P0C673 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Igsf11P0C673 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Igsf11P0C673 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Igsf11P0C673 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Igsf11P0C673 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igsf11P0C673 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igsf11P0C673 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Igsf11P0C673 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf11P0C673 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Igsf11P0C673 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf11P0C673 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf11P0C673 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Igsf11P0C673 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf11P0C673 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf11P0C673 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf11P0C673 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igsf11P0C673 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf11P0C673 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Igsf11P0C673 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Igsf11P0C673 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igsf11P0C673 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igsf11P0C673 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Igsf11P0C673 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf11P0C673 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Igsf11P0C673 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Igsf11P0C673 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf11P0C673 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Igsf11P0C673 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf11P0C673 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Igsf11P0C673 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Igsf11P0C673 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf11P0C673 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf11P0C673 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Igsf11P0C673 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Igsf11P0C673 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igsf11P0C673 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Igsf11P0C673 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igsf11P0C673 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Igsf11P0C673 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms