Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt4P07744 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt4P07744 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt4P07744 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt4P07744 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt4P07744 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt4P07744 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt4P07744 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt4P07744 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt4P07744 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt4P07744 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt4P07744 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt4P07744 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt4P07744 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt4P07744 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt4P07744 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt4P07744 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt4P07744 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt4P07744 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Krt4P07744 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Krt4P07744 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Krt4P07744 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt4P07744 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt4P07744 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Krt4P07744 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Krt4P07744 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt4P07744 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt4P07744 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt4P07744 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Krt4P07744 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt4P07744 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Krt4P07744 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Krt4P07744 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt4P07744 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Krt4P07744 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Krt4P07744 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt4P07744 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Krt4P07744 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Krt4P07744 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Krt4P07744 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt4P07744 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt4P07744 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Krt4P07744 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt4P07744 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt4P07744 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Krt4P07744 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Krt4P07744 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt4P07744 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Krt4P07744 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt4P07744 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt4P07744 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt4P07744 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Krt4P07744 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Krt4P07744 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Krt4P07744 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt4P07744 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Krt4P07744 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Krt4P07744 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Krt4P07744 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt4P07744 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt4P07744 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Krt4P07744 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt4P07744 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Krt4P07744 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Krt4P07744 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Krt4P07744 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt4P07744 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Krt4P07744 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Krt4P07744 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt4P07744 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Krt4P07744 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Krt4P07744 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt4P07744 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt4P07744 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt4P07744 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt4P07744 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms