Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
P06324 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
P06324 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
P06324 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
P06324 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,08■■□□□ 1,61
P06324 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
P06324 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
P06324 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
P06324 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
P06324 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25,02■■□□□ 1,6
P06324 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
P06324 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
P06324 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
P06324 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,98■■□□□ 1,59
P06324 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,98■■□□□ 1,59
P06324 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
P06324 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
P06324 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,97■■□□□ 1,59
P06324 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
P06324 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,95■■□□□ 1,58
P06324 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
P06324 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,95■■□□□ 1,58
P06324 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,93■■□□□ 1,58
P06324 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
P06324 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
P06324 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
P06324 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
P06324 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
P06324 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
P06324 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
P06324 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
P06324 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
P06324 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
P06324 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
P06324 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
P06324 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
P06324 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
P06324 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,84■■□□□ 1,57
P06324 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,83■■□□□ 1,57
P06324 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
P06324 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
P06324 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
P06324 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
P06324 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,78■■□□□ 1,56
P06324 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
P06324 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
P06324 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
P06324 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,75■■□□□ 1,55
P06324 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
P06324 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
P06324 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
P06324 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
P06324 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
P06324 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
P06324 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,55
P06324 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
P06324 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
P06324 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
P06324 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
P06324 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
P06324 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
P06324 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
P06324 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
P06324 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
P06324 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
P06324 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
P06324 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,61■■□□□ 1,53
P06324 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
P06324 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
P06324 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
P06324 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
P06324 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
P06324 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
P06324 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
P06324 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
P06324 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
P06324 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
P06324 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
P06324 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
P06324 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,48■■□□□ 1,51
P06324 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
P06324 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
P06324 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
P06324 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
P06324 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
P06324 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
P06324 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
P06324 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
P06324 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
P06324 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
P06324 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,51
P06324 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
P06324 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,45■■□□□ 1,5
P06324 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
P06324 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
P06324 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
P06324 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
P06324 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,4■■□□□ 1,5
P06324 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,4■■□□□ 1,5
P06324 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms