Protein–RNA interactions for Protein: P04942

Ig kappa chain V-VI region NQ5-61.1.2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04942 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,23■□□□□ 0,99
P04942 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21,23■□□□□ 0,99
P04942 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
P04942 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,23■□□□□ 0,99
P04942 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,22■□□□□ 0,99
P04942 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
P04942 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,2■□□□□ 0,99
P04942 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21,19■□□□□ 0,98
P04942 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
P04942 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
P04942 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
P04942 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
P04942 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
P04942 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,1■□□□□ 0,97
P04942 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
P04942 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21,07■□□□□ 0,96
P04942 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
P04942 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,06■□□□□ 0,96
P04942 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
P04942 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21,05■□□□□ 0,96
P04942 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,04■□□□□ 0,96
P04942 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
P04942 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
P04942 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21,03■□□□□ 0,96
P04942 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
P04942 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
P04942 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
P04942 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
P04942 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
P04942 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
P04942 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
P04942 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
P04942 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
P04942 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
P04942 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
P04942 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20,97■□□□□ 0,95
P04942 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,97■□□□□ 0,95
P04942 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
P04942 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20,95■□□□□ 0,94
P04942 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,94■□□□□ 0,94
P04942 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
P04942 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
P04942 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
P04942 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
P04942 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
P04942 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
P04942 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
P04942 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
P04942 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
P04942 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
P04942 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
P04942 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20,86■□□□□ 0,93
P04942 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
P04942 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
P04942 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20,84■□□□□ 0,93
P04942 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
P04942 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
P04942 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
P04942 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
P04942 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,79■□□□□ 0,92
P04942 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
P04942 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
P04942 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
P04942 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
P04942 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
P04942 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
P04942 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
P04942 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
P04942 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
P04942 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
P04942 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
P04942 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20,71■□□□□ 0,91
P04942 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
P04942 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
P04942 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20,7■□□□□ 0,9
P04942 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20,69■□□□□ 0,9
P04942 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
P04942 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
P04942 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
P04942 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
P04942 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
P04942 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
P04942 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20,68■□□□□ 0,9
P04942 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,67■□□□□ 0,9
P04942 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
P04942 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
P04942 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
P04942 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
P04942 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
P04942 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
P04942 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
P04942 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,9
P04942 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,9
P04942 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
P04942 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
P04942 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC20,63■□□□□ 0,89
P04942 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20,62■□□□□ 0,89
P04942 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
P04942 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
P04942 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,2 ms