Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P04213 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P04213 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P04213 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
P04213 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
P04213 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P04213 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
P04213 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
P04213 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P04213 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P04213 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
P04213 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
P04213 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
P04213 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
P04213 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
P04213 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
P04213 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P04213 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
P04213 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
P04213 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
P04213 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
P04213 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
P04213 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
P04213 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
P04213 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P04213 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P04213 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
P04213 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
P04213 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
P04213 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
P04213 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
P04213 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
P04213 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
P04213 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
P04213 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
P04213 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
P04213 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
P04213 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
P04213 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P04213 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
P04213 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
P04213 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P04213 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
P04213 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P04213 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
P04213 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
P04213 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
P04213 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P04213 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P04213 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P04213 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P04213 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P04213 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P04213 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
P04213 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P04213 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P04213 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P04213 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P04213 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
P04213 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P04213 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P04213 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P04213 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P04213 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P04213 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P04213 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P04213 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
P04213 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
P04213 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
P04213 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P04213 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P04213 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
P04213 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P04213 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P04213 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P04213 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
P04213 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P04213 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
P04213 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P04213 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P04213 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P04213 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P04213 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
P04213 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
P04213 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P04213 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
P04213 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
P04213 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P04213 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
P04213 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
P04213 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
P04213 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P04213 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
P04213 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P04213 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
P04213 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
P04213 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
P04213 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
P04213 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
P04213 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms