Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01800 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
P01800 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01800 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01800 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P01800 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01800 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01800 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
P01800 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01800 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01800 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01800 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01800 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
P01800 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
P01800 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
P01800 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
P01800 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01800 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01800 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01800 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
P01800 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
P01800 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
P01800 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01800 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01800 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01800 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01800 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01800 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01800 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01800 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01800 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01800 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01800 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01800 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01800 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01800 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
P01800 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01800 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01800 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01800 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01800 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01800 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01800 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01800 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01800 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01800 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01800 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01800 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P01800 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01800 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01800 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01800 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01800 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01800 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01800 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01800 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01800 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01800 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
P01800 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
P01800 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
P01800 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
P01800 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01800 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01800 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01800 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01800 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01800 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01800 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01800 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01800 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01800 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01800 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01800 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
P01800 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01800 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01800 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01800 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01800 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01800 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01800 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01800 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
P01800 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01800 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P01800 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01800 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01800 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P01800 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
P01800 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
P01800 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01800 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01800 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
P01800 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P01800 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P01800 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01800 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01800 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01800 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P01800 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01800 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P01800 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms