Protein–RNA interactions for Protein: P01587

Csf2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf2P01587 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Csf2P01587 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Csf2P01587 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Csf2P01587 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csf2P01587 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csf2P01587 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Csf2P01587 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csf2P01587 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csf2P01587 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csf2P01587 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Csf2P01587 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Csf2P01587 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Csf2P01587 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Csf2P01587 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Csf2P01587 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Csf2P01587 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Csf2P01587 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csf2P01587 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csf2P01587 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Csf2P01587 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Csf2P01587 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Csf2P01587 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csf2P01587 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Csf2P01587 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csf2P01587 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Csf2P01587 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Csf2P01587 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Csf2P01587 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2P01587 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Csf2P01587 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2P01587 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2P01587 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2P01587 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Csf2P01587 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csf2P01587 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Csf2P01587 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Csf2P01587 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Csf2P01587 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Csf2P01587 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csf2P01587 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Csf2P01587 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Csf2P01587 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csf2P01587 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csf2P01587 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Csf2P01587 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Csf2P01587 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csf2P01587 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Csf2P01587 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Csf2P01587 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csf2P01587 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Csf2P01587 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Csf2P01587 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Csf2P01587 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csf2P01587 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Csf2P01587 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csf2P01587 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Csf2P01587 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Csf2P01587 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Csf2P01587 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csf2P01587 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Csf2P01587 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Csf2P01587 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Csf2P01587 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Csf2P01587 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Csf2P01587 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csf2P01587 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csf2P01587 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Csf2P01587 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Csf2P01587 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Csf2P01587 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Csf2P01587 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csf2P01587 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Csf2P01587 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms