Protein–RNA interactions for Protein: O89019

Invs, Inversin, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InvsO89019 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
InvsO89019 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
InvsO89019 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
InvsO89019 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
InvsO89019 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
InvsO89019 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
InvsO89019 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
InvsO89019 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
InvsO89019 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
InvsO89019 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
InvsO89019 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
InvsO89019 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
InvsO89019 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
InvsO89019 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
InvsO89019 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
InvsO89019 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
InvsO89019 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
InvsO89019 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
InvsO89019 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
InvsO89019 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
InvsO89019 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
InvsO89019 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
InvsO89019 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
InvsO89019 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
InvsO89019 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
InvsO89019 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
InvsO89019 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
InvsO89019 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
InvsO89019 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
InvsO89019 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
InvsO89019 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
InvsO89019 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
InvsO89019 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
InvsO89019 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
InvsO89019 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
InvsO89019 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
InvsO89019 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
InvsO89019 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
InvsO89019 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
InvsO89019 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
InvsO89019 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
InvsO89019 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
InvsO89019 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
InvsO89019 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
InvsO89019 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
InvsO89019 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
InvsO89019 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
InvsO89019 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
InvsO89019 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
InvsO89019 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
InvsO89019 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
InvsO89019 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
InvsO89019 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
InvsO89019 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
InvsO89019 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
InvsO89019 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
InvsO89019 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
InvsO89019 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
InvsO89019 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
InvsO89019 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
InvsO89019 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
InvsO89019 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
InvsO89019 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
InvsO89019 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
InvsO89019 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
InvsO89019 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
InvsO89019 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
InvsO89019 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
InvsO89019 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
InvsO89019 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
InvsO89019 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
InvsO89019 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
InvsO89019 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
InvsO89019 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
InvsO89019 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
InvsO89019 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
InvsO89019 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
InvsO89019 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
InvsO89019 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
InvsO89019 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
InvsO89019 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
InvsO89019 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
InvsO89019 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
InvsO89019 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
InvsO89019 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
InvsO89019 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
InvsO89019 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
InvsO89019 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
InvsO89019 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
InvsO89019 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
InvsO89019 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
InvsO89019 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
InvsO89019 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
InvsO89019 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
InvsO89019 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
InvsO89019 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
InvsO89019 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
InvsO89019 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
InvsO89019 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
InvsO89019 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms