Protein–RNA interactions for Protein: O89019

Invs, Inversin, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InvsO89019 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
InvsO89019 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
InvsO89019 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
InvsO89019 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
InvsO89019 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
InvsO89019 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
InvsO89019 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,77■■□□□ 1,72
InvsO89019 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
InvsO89019 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
InvsO89019 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
InvsO89019 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
InvsO89019 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
InvsO89019 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
InvsO89019 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
InvsO89019 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
InvsO89019 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
InvsO89019 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
InvsO89019 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
InvsO89019 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
InvsO89019 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
InvsO89019 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
InvsO89019 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
InvsO89019 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
InvsO89019 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
InvsO89019 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
InvsO89019 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
InvsO89019 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,58■■□□□ 1,69
InvsO89019 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
InvsO89019 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
InvsO89019 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
InvsO89019 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25,53■■□□□ 1,68
InvsO89019 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,52■■□□□ 1,68
InvsO89019 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
InvsO89019 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
InvsO89019 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
InvsO89019 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
InvsO89019 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
InvsO89019 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
InvsO89019 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
InvsO89019 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,67
InvsO89019 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
InvsO89019 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
InvsO89019 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
InvsO89019 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
InvsO89019 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
InvsO89019 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
InvsO89019 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,41■■□□□ 1,66
InvsO89019 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
InvsO89019 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
InvsO89019 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
InvsO89019 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
InvsO89019 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
InvsO89019 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,36■■□□□ 1,65
InvsO89019 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
InvsO89019 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
InvsO89019 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,34■■□□□ 1,65
InvsO89019 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
InvsO89019 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,33■■□□□ 1,65
InvsO89019 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,64
InvsO89019 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
InvsO89019 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,32■■□□□ 1,64
InvsO89019 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
InvsO89019 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
InvsO89019 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
InvsO89019 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
InvsO89019 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,29■■□□□ 1,64
InvsO89019 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,28■■□□□ 1,64
InvsO89019 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,27■■□□□ 1,64
InvsO89019 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
InvsO89019 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,26■■□□□ 1,63
InvsO89019 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
InvsO89019 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
InvsO89019 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
InvsO89019 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
InvsO89019 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
InvsO89019 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
InvsO89019 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
InvsO89019 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
InvsO89019 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,63
InvsO89019 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
InvsO89019 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,2■■□□□ 1,62
InvsO89019 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
InvsO89019 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
InvsO89019 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
InvsO89019 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
InvsO89019 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
InvsO89019 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
InvsO89019 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
InvsO89019 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
InvsO89019 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
InvsO89019 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25,09■■□□□ 1,61
InvsO89019 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
InvsO89019 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
InvsO89019 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
InvsO89019 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,07■■□□□ 1,6
InvsO89019 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
InvsO89019 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
InvsO89019 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
InvsO89019 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
InvsO89019 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,05■■□□□ 1,6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60,8 ms