Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lrrc6O88978 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lrrc6O88978 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lrrc6O88978 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lrrc6O88978 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lrrc6O88978 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lrrc6O88978 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc6O88978 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc6O88978 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc6O88978 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc6O88978 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc6O88978 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Lrrc6O88978 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lrrc6O88978 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lrrc6O88978 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lrrc6O88978 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lrrc6O88978 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lrrc6O88978 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lrrc6O88978 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lrrc6O88978 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lrrc6O88978 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lrrc6O88978 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc6O88978 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lrrc6O88978 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lrrc6O88978 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc6O88978 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc6O88978 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lrrc6O88978 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lrrc6O88978 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc6O88978 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc6O88978 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lrrc6O88978 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lrrc6O88978 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrrc6O88978 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Lrrc6O88978 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Lrrc6O88978 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lrrc6O88978 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrc6O88978 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrc6O88978 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrc6O88978 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lrrc6O88978 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lrrc6O88978 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrc6O88978 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Lrrc6O88978 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lrrc6O88978 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrrc6O88978 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Lrrc6O88978 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc6O88978 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc6O88978 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc6O88978 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lrrc6O88978 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Lrrc6O88978 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc6O88978 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc6O88978 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Lrrc6O88978 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrc6O88978 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc6O88978 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc6O88978 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrc6O88978 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc6O88978 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc6O88978 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrc6O88978 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc6O88978 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lrrc6O88978 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc6O88978 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc6O88978 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrc6O88978 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrc6O88978 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrc6O88978 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc6O88978 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lrrc6O88978 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrc6O88978 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc6O88978 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrc6O88978 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrc6O88978 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrc6O88978 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrc6O88978 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrc6O88978 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms