Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brd7O88665 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brd7O88665 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brd7O88665 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd7O88665 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brd7O88665 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd7O88665 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd7O88665 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd7O88665 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd7O88665 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd7O88665 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd7O88665 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd7O88665 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd7O88665 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Brd7O88665 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd7O88665 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Brd7O88665 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Brd7O88665 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Brd7O88665 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brd7O88665 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd7O88665 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brd7O88665 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd7O88665 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brd7O88665 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd7O88665 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd7O88665 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brd7O88665 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd7O88665 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd7O88665 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Brd7O88665 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Brd7O88665 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Brd7O88665 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd7O88665 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brd7O88665 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd7O88665 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd7O88665 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd7O88665 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brd7O88665 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd7O88665 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Brd7O88665 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Brd7O88665 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd7O88665 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd7O88665 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Brd7O88665 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd7O88665 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd7O88665 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd7O88665 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd7O88665 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd7O88665 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd7O88665 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd7O88665 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd7O88665 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd7O88665 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms