Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Vti1bO88384 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,49■■□□□ 1,51
Vti1bO88384 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Vti1bO88384 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Vti1bO88384 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,48■■□□□ 1,51
Vti1bO88384 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Vti1bO88384 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Vti1bO88384 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Vti1bO88384 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Vti1bO88384 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Vti1bO88384 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Vti1bO88384 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Vti1bO88384 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Vti1bO88384 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Vti1bO88384 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Vti1bO88384 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Vti1bO88384 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Vti1bO88384 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Vti1bO88384 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Vti1bO88384 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Vti1bO88384 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,32■■□□□ 1,48
Vti1bO88384 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Vti1bO88384 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Vti1bO88384 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
Vti1bO88384 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Vti1bO88384 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,27■■□□□ 1,48
Vti1bO88384 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Vti1bO88384 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Vti1bO88384 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Vti1bO88384 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
Vti1bO88384 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Vti1bO88384 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Vti1bO88384 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Vti1bO88384 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Vti1bO88384 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Vti1bO88384 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Vti1bO88384 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Vti1bO88384 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Vti1bO88384 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Vti1bO88384 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Vti1bO88384 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Vti1bO88384 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,14■■□□□ 1,46
Vti1bO88384 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Vti1bO88384 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Vti1bO88384 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Vti1bO88384 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Vti1bO88384 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,11■■□□□ 1,45
Vti1bO88384 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Vti1bO88384 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Vti1bO88384 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Vti1bO88384 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Vti1bO88384 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,09■■□□□ 1,45
Vti1bO88384 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Vti1bO88384 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Vti1bO88384 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Vti1bO88384 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Vti1bO88384 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Vti1bO88384 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Vti1bO88384 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Vti1bO88384 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Vti1bO88384 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Vti1bO88384 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,02■■□□□ 1,44
Vti1bO88384 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Vti1bO88384 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Vti1bO88384 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Vti1bO88384 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1,43
Vti1bO88384 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Vti1bO88384 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23,94■■□□□ 1,42
Vti1bO88384 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Vti1bO88384 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Vti1bO88384 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Vti1bO88384 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,93■■□□□ 1,42
Vti1bO88384 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,92■■□□□ 1,42
Vti1bO88384 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,92■■□□□ 1,42
Vti1bO88384 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23,9■■□□□ 1,42
Vti1bO88384 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,41
Vti1bO88384 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Vti1bO88384 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Vti1bO88384 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Vti1bO88384 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Vti1bO88384 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Vti1bO88384 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Vti1bO88384 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,84■■□□□ 1,41
Vti1bO88384 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Vti1bO88384 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Vti1bO88384 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23,83■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,82■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Vti1bO88384 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,8 ms