Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vti1bO88384 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Vti1bO88384 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vti1bO88384 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vti1bO88384 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vti1bO88384 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vti1bO88384 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vti1bO88384 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vti1bO88384 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vti1bO88384 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Vti1bO88384 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vti1bO88384 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vti1bO88384 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vti1bO88384 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vti1bO88384 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vti1bO88384 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vti1bO88384 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vti1bO88384 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Vti1bO88384 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vti1bO88384 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vti1bO88384 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vti1bO88384 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vti1bO88384 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vti1bO88384 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vti1bO88384 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vti1bO88384 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Vti1bO88384 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vti1bO88384 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vti1bO88384 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vti1bO88384 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vti1bO88384 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vti1bO88384 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vti1bO88384 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vti1bO88384 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vti1bO88384 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vti1bO88384 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vti1bO88384 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vti1bO88384 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vti1bO88384 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vti1bO88384 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vti1bO88384 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vti1bO88384 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Vti1bO88384 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vti1bO88384 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vti1bO88384 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vti1bO88384 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vti1bO88384 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vti1bO88384 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vti1bO88384 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vti1bO88384 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vti1bO88384 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vti1bO88384 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Vti1bO88384 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1bO88384 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1bO88384 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1bO88384 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1bO88384 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vti1bO88384 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vti1bO88384 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vti1bO88384 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vti1bO88384 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vti1bO88384 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vti1bO88384 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vti1bO88384 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vti1bO88384 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vti1bO88384 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vti1bO88384 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vti1bO88384 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vti1bO88384 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vti1bO88384 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vti1bO88384 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vti1bO88384 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vti1bO88384 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vti1bO88384 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vti1bO88384 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vti1bO88384 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vti1bO88384 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vti1bO88384 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vti1bO88384 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vti1bO88384 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vti1bO88384 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vti1bO88384 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vti1bO88384 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Vti1bO88384 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vti1bO88384 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vti1bO88384 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vti1bO88384 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms