Protein–RNA interactions for Protein: O70404

Vamp8, Vesicle-associated membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp8O70404 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp8O70404 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp8O70404 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp8O70404 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp8O70404 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp8O70404 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp8O70404 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp8O70404 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp8O70404 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vamp8O70404 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp8O70404 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vamp8O70404 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vamp8O70404 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vamp8O70404 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vamp8O70404 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp8O70404 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vamp8O70404 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vamp8O70404 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vamp8O70404 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp8O70404 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp8O70404 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp8O70404 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp8O70404 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp8O70404 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp8O70404 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp8O70404 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp8O70404 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp8O70404 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp8O70404 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp8O70404 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp8O70404 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp8O70404 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp8O70404 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp8O70404 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp8O70404 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp8O70404 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp8O70404 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp8O70404 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp8O70404 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vamp8O70404 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 400.9 ms