Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
ChkbO55229 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27,44■■□□□ 1,98
ChkbO55229 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
ChkbO55229 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
ChkbO55229 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
ChkbO55229 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
ChkbO55229 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
ChkbO55229 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
ChkbO55229 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
ChkbO55229 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,36■■□□□ 1,97
ChkbO55229 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
ChkbO55229 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
ChkbO55229 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
ChkbO55229 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
ChkbO55229 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
ChkbO55229 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
ChkbO55229 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
ChkbO55229 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
ChkbO55229 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
ChkbO55229 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
ChkbO55229 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
ChkbO55229 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,2■■□□□ 1,94
ChkbO55229 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
ChkbO55229 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
ChkbO55229 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
ChkbO55229 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,17■■□□□ 1,94
ChkbO55229 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
ChkbO55229 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,16■■□□□ 1,94
ChkbO55229 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
ChkbO55229 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27,14■■□□□ 1,94
ChkbO55229 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,93
ChkbO55229 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
ChkbO55229 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
ChkbO55229 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
ChkbO55229 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
ChkbO55229 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
ChkbO55229 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
ChkbO55229 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
ChkbO55229 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
ChkbO55229 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
ChkbO55229 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
ChkbO55229 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
ChkbO55229 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
ChkbO55229 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
ChkbO55229 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
ChkbO55229 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
ChkbO55229 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
ChkbO55229 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
ChkbO55229 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
ChkbO55229 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
ChkbO55229 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,97■■□□□ 1,91
ChkbO55229 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
ChkbO55229 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
ChkbO55229 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,94■■□□□ 1,9
ChkbO55229 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
ChkbO55229 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,92■■□□□ 1,9
ChkbO55229 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,92■■□□□ 1,9
ChkbO55229 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
ChkbO55229 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
ChkbO55229 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,88■■□□□ 1,89
ChkbO55229 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
ChkbO55229 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
ChkbO55229 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
ChkbO55229 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
ChkbO55229 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,84■■□□□ 1,89
ChkbO55229 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,89
ChkbO55229 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,81■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26,79■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,79■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
ChkbO55229 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
ChkbO55229 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
ChkbO55229 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
ChkbO55229 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
ChkbO55229 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
ChkbO55229 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
ChkbO55229 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
ChkbO55229 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,87
ChkbO55229 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
ChkbO55229 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
ChkbO55229 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
ChkbO55229 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
ChkbO55229 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
ChkbO55229 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
ChkbO55229 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,67■■□□□ 1,86
ChkbO55229 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26,66■■□□□ 1,86
ChkbO55229 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
ChkbO55229 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,1 ms