Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pja1O55176 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pja1O55176 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Pja1O55176 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pja1O55176 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pja1O55176 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pja1O55176 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pja1O55176 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pja1O55176 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pja1O55176 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pja1O55176 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Pja1O55176 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Pja1O55176 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pja1O55176 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pja1O55176 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pja1O55176 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pja1O55176 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pja1O55176 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pja1O55176 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pja1O55176 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pja1O55176 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pja1O55176 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pja1O55176 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pja1O55176 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pja1O55176 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Pja1O55176 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pja1O55176 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pja1O55176 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pja1O55176 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pja1O55176 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pja1O55176 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pja1O55176 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pja1O55176 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pja1O55176 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Pja1O55176 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pja1O55176 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pja1O55176 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pja1O55176 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pja1O55176 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pja1O55176 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Pja1O55176 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pja1O55176 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pja1O55176 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pja1O55176 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pja1O55176 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pja1O55176 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pja1O55176 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Pja1O55176 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pja1O55176 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pja1O55176 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pja1O55176 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pja1O55176 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pja1O55176 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pja1O55176 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pja1O55176 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Pja1O55176 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pja1O55176 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pja1O55176 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pja1O55176 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pja1O55176 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pja1O55176 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pja1O55176 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pja1O55176 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pja1O55176 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Pja1O55176 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pja1O55176 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pja1O55176 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pja1O55176 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pja1O55176 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pja1O55176 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pja1O55176 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pja1O55176 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pja1O55176 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pja1O55176 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pja1O55176 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pja1O55176 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pja1O55176 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pja1O55176 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pja1O55176 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pja1O55176 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pja1O55176 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pja1O55176 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pja1O55176 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pja1O55176 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pja1O55176 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pja1O55176 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pja1O55176 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pja1O55176 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pja1O55176 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms