Protein–RNA interactions for Protein: O54901

Cd200, OX-2 membrane glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200O54901 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cd200O54901 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd200O54901 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd200O54901 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cd200O54901 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd200O54901 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd200O54901 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd200O54901 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd200O54901 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd200O54901 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd200O54901 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd200O54901 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd200O54901 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd200O54901 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd200O54901 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd200O54901 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd200O54901 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd200O54901 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd200O54901 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd200O54901 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd200O54901 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd200O54901 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd200O54901 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd200O54901 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cd200O54901 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cd200O54901 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms