Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mmp15O54732 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mmp15O54732 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mmp15O54732 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mmp15O54732 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mmp15O54732 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mmp15O54732 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mmp15O54732 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mmp15O54732 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Mmp15O54732 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Mmp15O54732 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Mmp15O54732 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Mmp15O54732 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Mmp15O54732 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Mmp15O54732 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Mmp15O54732 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mmp15O54732 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Mmp15O54732 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mmp15O54732 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mmp15O54732 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Mmp15O54732 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Mmp15O54732 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mmp15O54732 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mmp15O54732 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Mmp15O54732 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Mmp15O54732 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mmp15O54732 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Mmp15O54732 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Mmp15O54732 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mmp15O54732 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mmp15O54732 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Mmp15O54732 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Mmp15O54732 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mmp15O54732 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mmp15O54732 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Mmp15O54732 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mmp15O54732 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mmp15O54732 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mmp15O54732 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Mmp15O54732 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Mmp15O54732 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mmp15O54732 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mmp15O54732 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mmp15O54732 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mmp15O54732 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mmp15O54732 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mmp15O54732 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mmp15O54732 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mmp15O54732 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mmp15O54732 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mmp15O54732 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mmp15O54732 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp15O54732 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp15O54732 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mmp15O54732 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mmp15O54732 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mmp15O54732 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mmp15O54732 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mmp15O54732 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mmp15O54732 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mmp15O54732 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mmp15O54732 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mmp15O54732 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mmp15O54732 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mmp15O54732 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mmp15O54732 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mmp15O54732 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mmp15O54732 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mmp15O54732 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mmp15O54732 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mmp15O54732 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Mmp15O54732 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Mmp15O54732 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Mmp15O54732 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Mmp15O54732 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mmp15O54732 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.4 ms