Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccrl2O35457 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccrl2O35457 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccrl2O35457 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccrl2O35457 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccrl2O35457 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccrl2O35457 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccrl2O35457 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccrl2O35457 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccrl2O35457 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccrl2O35457 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccrl2O35457 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccrl2O35457 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccrl2O35457 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccrl2O35457 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccrl2O35457 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccrl2O35457 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccrl2O35457 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccrl2O35457 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccrl2O35457 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccrl2O35457 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccrl2O35457 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccrl2O35457 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccrl2O35457 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccrl2O35457 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccrl2O35457 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccrl2O35457 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccrl2O35457 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccrl2O35457 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccrl2O35457 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccrl2O35457 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccrl2O35457 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccrl2O35457 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccrl2O35457 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccrl2O35457 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccrl2O35457 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccrl2O35457 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccrl2O35457 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccrl2O35457 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccrl2O35457 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccrl2O35457 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccrl2O35457 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccrl2O35457 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccrl2O35457 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccrl2O35457 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccrl2O35457 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccrl2O35457 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccrl2O35457 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccrl2O35457 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccrl2O35457 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccrl2O35457 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccrl2O35457 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ccrl2O35457 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccrl2O35457 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccrl2O35457 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccrl2O35457 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccrl2O35457 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccrl2O35457 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccrl2O35457 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccrl2O35457 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccrl2O35457 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccrl2O35457 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccrl2O35457 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccrl2O35457 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ccrl2O35457 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ccrl2O35457 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccrl2O35457 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ccrl2O35457 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ccrl2O35457 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ccrl2O35457 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccrl2O35457 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccrl2O35457 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ccrl2O35457 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ccrl2O35457 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ccrl2O35457 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccrl2O35457 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccrl2O35457 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ccrl2O35457 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccrl2O35457 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccrl2O35457 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccrl2O35457 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccrl2O35457 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccrl2O35457 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccrl2O35457 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccrl2O35457 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccrl2O35457 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccrl2O35457 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms