Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc18a3O35304 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc18a3O35304 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc18a3O35304 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc18a3O35304 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc18a3O35304 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc18a3O35304 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc18a3O35304 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc18a3O35304 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc18a3O35304 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc18a3O35304 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc18a3O35304 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc18a3O35304 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc18a3O35304 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc18a3O35304 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc18a3O35304 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc18a3O35304 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc18a3O35304 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc18a3O35304 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms