Protein–RNA interactions for Protein: O35242

Nsmaf, Protein FAN, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmafO35242 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NsmafO35242 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NsmafO35242 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NsmafO35242 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NsmafO35242 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NsmafO35242 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NsmafO35242 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NsmafO35242 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NsmafO35242 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NsmafO35242 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NsmafO35242 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NsmafO35242 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NsmafO35242 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NsmafO35242 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NsmafO35242 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NsmafO35242 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NsmafO35242 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NsmafO35242 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmafO35242 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NsmafO35242 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NsmafO35242 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NsmafO35242 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NsmafO35242 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NsmafO35242 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NsmafO35242 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NsmafO35242 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NsmafO35242 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NsmafO35242 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NsmafO35242 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NsmafO35242 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NsmafO35242 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NsmafO35242 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NsmafO35242 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NsmafO35242 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NsmafO35242 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NsmafO35242 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NsmafO35242 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NsmafO35242 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NsmafO35242 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NsmafO35242 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NsmafO35242 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NsmafO35242 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NsmafO35242 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NsmafO35242 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NsmafO35242 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NsmafO35242 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmafO35242 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmafO35242 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NsmafO35242 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NsmafO35242 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NsmafO35242 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NsmafO35242 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NsmafO35242 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NsmafO35242 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NsmafO35242 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NsmafO35242 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NsmafO35242 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NsmafO35242 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmafO35242 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmafO35242 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NsmafO35242 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmafO35242 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmafO35242 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmafO35242 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NsmafO35242 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NsmafO35242 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NsmafO35242 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NsmafO35242 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NsmafO35242 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NsmafO35242 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NsmafO35242 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NsmafO35242 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NsmafO35242 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NsmafO35242 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NsmafO35242 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NsmafO35242 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NsmafO35242 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NsmafO35242 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmafO35242 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmafO35242 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NsmafO35242 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NsmafO35242 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NsmafO35242 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NsmafO35242 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NsmafO35242 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NsmafO35242 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NsmafO35242 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmafO35242 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NsmafO35242 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms