Protein–RNA interactions for Protein: O08746

Matn2, Matrilin-2, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn2O08746 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Matn2O08746 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Matn2O08746 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Matn2O08746 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Matn2O08746 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Matn2O08746 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Matn2O08746 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Matn2O08746 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Matn2O08746 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Matn2O08746 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Matn2O08746 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Matn2O08746 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Matn2O08746 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Matn2O08746 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Matn2O08746 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Matn2O08746 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Matn2O08746 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Matn2O08746 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Matn2O08746 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Matn2O08746 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Matn2O08746 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Matn2O08746 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Matn2O08746 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Matn2O08746 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Matn2O08746 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Matn2O08746 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Matn2O08746 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Matn2O08746 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Matn2O08746 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Matn2O08746 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Matn2O08746 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Matn2O08746 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Matn2O08746 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Matn2O08746 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Matn2O08746 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Matn2O08746 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Matn2O08746 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Matn2O08746 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Matn2O08746 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Matn2O08746 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Matn2O08746 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Matn2O08746 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Matn2O08746 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Matn2O08746 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Matn2O08746 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Matn2O08746 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Matn2O08746 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Matn2O08746 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Matn2O08746 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Matn2O08746 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Matn2O08746 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Matn2O08746 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Matn2O08746 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Matn2O08746 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Matn2O08746 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Matn2O08746 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Matn2O08746 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Matn2O08746 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Matn2O08746 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Matn2O08746 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Matn2O08746 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Matn2O08746 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Matn2O08746 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Matn2O08746 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Matn2O08746 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Matn2O08746 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Matn2O08746 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Matn2O08746 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Matn2O08746 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Matn2O08746 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Matn2O08746 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Matn2O08746 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Matn2O08746 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Matn2O08746 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Matn2O08746 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matn2O08746 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Matn2O08746 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Matn2O08746 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Matn2O08746 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Matn2O08746 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Matn2O08746 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Matn2O08746 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Matn2O08746 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Matn2O08746 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Matn2O08746 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Matn2O08746 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Matn2O08746 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Matn2O08746 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Matn2O08746 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Matn2O08746 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Matn2O08746 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Matn2O08746 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Matn2O08746 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Matn2O08746 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Matn2O08746 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Matn2O08746 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Matn2O08746 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Matn2O08746 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Matn2O08746 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Matn2O08746 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms