Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Vwa3bJ9JI28 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Vwa3bJ9JI28 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Vwa3bJ9JI28 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Vwa3bJ9JI28 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Vwa3bJ9JI28 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Vwa3bJ9JI28 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Vwa3bJ9JI28 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Vwa3bJ9JI28 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Vwa3bJ9JI28 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Vwa3bJ9JI28 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Vwa3bJ9JI28 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Vwa3bJ9JI28 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Vwa3bJ9JI28 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Vwa3bJ9JI28 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Vwa3bJ9JI28 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Vwa3bJ9JI28 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Vwa3bJ9JI28 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Vwa3bJ9JI28 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Vwa3bJ9JI28 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
Vwa3bJ9JI28 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Vwa3bJ9JI28 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Vwa3bJ9JI28 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Vwa3bJ9JI28 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Vwa3bJ9JI28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Vwa3bJ9JI28 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Vwa3bJ9JI28 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Vwa3bJ9JI28 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Vwa3bJ9JI28 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Vwa3bJ9JI28 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Vwa3bJ9JI28 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Vwa3bJ9JI28 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Vwa3bJ9JI28 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Vwa3bJ9JI28 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Vwa3bJ9JI28 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Vwa3bJ9JI28 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Vwa3bJ9JI28 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Vwa3bJ9JI28 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Vwa3bJ9JI28 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Vwa3bJ9JI28 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Vwa3bJ9JI28 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Vwa3bJ9JI28 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Vwa3bJ9JI28 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Vwa3bJ9JI28 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Vwa3bJ9JI28 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Vwa3bJ9JI28 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Vwa3bJ9JI28 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vwa3bJ9JI28 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Vwa3bJ9JI28 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Vwa3bJ9JI28 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Vwa3bJ9JI28 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Vwa3bJ9JI28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Vwa3bJ9JI28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Vwa3bJ9JI28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vwa3bJ9JI28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Vwa3bJ9JI28 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Vwa3bJ9JI28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vwa3bJ9JI28 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vwa3bJ9JI28 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vwa3bJ9JI28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Vwa3bJ9JI28 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Vwa3bJ9JI28 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Vwa3bJ9JI28 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Vwa3bJ9JI28 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Vwa3bJ9JI28 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Vwa3bJ9JI28 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vwa3bJ9JI28 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vwa3bJ9JI28 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vwa3bJ9JI28 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vwa3bJ9JI28 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Vwa3bJ9JI28 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Vwa3bJ9JI28 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Vwa3bJ9JI28 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Vwa3bJ9JI28 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Vwa3bJ9JI28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Vwa3bJ9JI28 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Vwa3bJ9JI28 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Vwa3bJ9JI28 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Vwa3bJ9JI28 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Vwa3bJ9JI28 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Vwa3bJ9JI28 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vwa3bJ9JI28 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Vwa3bJ9JI28 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Vwa3bJ9JI28 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Vwa3bJ9JI28 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Vwa3bJ9JI28 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Vwa3bJ9JI28 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Vwa3bJ9JI28 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Vwa3bJ9JI28 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms