Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gm17577J3QNF7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm17577J3QNF7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm17577J3QNF7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm17577J3QNF7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm17577J3QNF7 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm17577J3QNF7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm17577J3QNF7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm17577J3QNF7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm17577J3QNF7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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