Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm20834J3QM72 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm20834J3QM72 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm20834J3QM72 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm20834J3QM72 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm20834J3QM72 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm20834J3QM72 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20834J3QM72 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm20834J3QM72 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20834J3QM72 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm20834J3QM72 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm20834J3QM72 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20834J3QM72 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm20834J3QM72 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20834J3QM72 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm20834J3QM72 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm20834J3QM72 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm20834J3QM72 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm20834J3QM72 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm20834J3QM72 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20834J3QM72 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm20834J3QM72 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm20834J3QM72 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm20834J3QM72 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20834J3QM72 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20834J3QM72 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm20834J3QM72 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm20834J3QM72 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm20834J3QM72 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm20834J3QM72 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm20834J3QM72 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm20834J3QM72 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20834J3QM72 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20834J3QM72 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm20834J3QM72 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20834J3QM72 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gm20834J3QM72 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gm20834J3QM72 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20834J3QM72 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gm20834J3QM72 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20834J3QM72 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20834J3QM72 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm20834J3QM72 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm20834J3QM72 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm20834J3QM72 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm20834J3QM72 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20834J3QM72 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm20834J3QM72 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm20834J3QM72 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm20834J3QM72 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20834J3QM72 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm20834J3QM72 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gm20834J3QM72 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20834J3QM72 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gm20834J3QM72 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20834J3QM72 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gm20834J3QM72 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20834J3QM72 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gm20834J3QM72 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gm20834J3QM72 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20834J3QM72 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gm20834J3QM72 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20834J3QM72 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20834J3QM72 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm20834J3QM72 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm20834J3QM72 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20834J3QM72 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20834J3QM72 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm20834J3QM72 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20834J3QM72 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm20834J3QM72 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20834J3QM72 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm20834J3QM72 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm20834J3QM72 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm20834J3QM72 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm20834J3QM72 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm20834J3QM72 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms