Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r12G5E8G1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn1r12G5E8G1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r12G5E8G1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r12G5E8G1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r12G5E8G1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r12G5E8G1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r12G5E8G1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r12G5E8G1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r12G5E8G1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r12G5E8G1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r12G5E8G1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r12G5E8G1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r12G5E8G1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r12G5E8G1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r12G5E8G1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn1r12G5E8G1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r12G5E8G1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r12G5E8G1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r12G5E8G1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r12G5E8G1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r12G5E8G1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r12G5E8G1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r12G5E8G1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r12G5E8G1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r12G5E8G1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r12G5E8G1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r12G5E8G1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r12G5E8G1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r12G5E8G1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r12G5E8G1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r12G5E8G1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r12G5E8G1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r12G5E8G1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r12G5E8G1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r12G5E8G1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r12G5E8G1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r12G5E8G1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r12G5E8G1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r12G5E8G1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r12G5E8G1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r12G5E8G1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r12G5E8G1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r12G5E8G1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r12G5E8G1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r12G5E8G1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r12G5E8G1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r12G5E8G1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r12G5E8G1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r12G5E8G1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r12G5E8G1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vmn1r12G5E8G1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r12G5E8G1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn1r12G5E8G1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r12G5E8G1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn1r12G5E8G1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r12G5E8G1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn1r12G5E8G1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn1r12G5E8G1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r12G5E8G1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r12G5E8G1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn1r12G5E8G1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r12G5E8G1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r12G5E8G1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vmn1r12G5E8G1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r12G5E8G1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r12G5E8G1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn1r12G5E8G1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn1r12G5E8G1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r12G5E8G1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r12G5E8G1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn1r12G5E8G1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r12G5E8G1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn1r12G5E8G1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r12G5E8G1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn1r12G5E8G1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vmn1r12G5E8G1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vmn1r12G5E8G1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r12G5E8G1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r12G5E8G1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vmn1r12G5E8G1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vmn1r12G5E8G1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r12G5E8G1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vmn1r12G5E8G1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vmn1r12G5E8G1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms