Protein–RNA interactions for Protein: G3X9I7

Zc3h12b, MCG2522, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12bG3X9I7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Zc3h12bG3X9I7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zc3h12bG3X9I7 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zc3h12bG3X9I7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Zc3h12bG3X9I7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Zc3h12bG3X9I7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Zc3h12bG3X9I7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Zc3h12bG3X9I7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Zc3h12bG3X9I7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Zc3h12bG3X9I7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Zc3h12bG3X9I7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Zc3h12bG3X9I7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Zc3h12bG3X9I7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Zc3h12bG3X9I7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zc3h12bG3X9I7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Zc3h12bG3X9I7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Zc3h12bG3X9I7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Zc3h12bG3X9I7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Zc3h12bG3X9I7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Zc3h12bG3X9I7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zc3h12bG3X9I7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Zc3h12bG3X9I7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Zc3h12bG3X9I7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zc3h12bG3X9I7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Zc3h12bG3X9I7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Zc3h12bG3X9I7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Zc3h12bG3X9I7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zc3h12bG3X9I7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Zc3h12bG3X9I7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Zc3h12bG3X9I7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Zc3h12bG3X9I7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zc3h12bG3X9I7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zc3h12bG3X9I7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Zc3h12bG3X9I7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zc3h12bG3X9I7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Zc3h12bG3X9I7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zc3h12bG3X9I7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Zc3h12bG3X9I7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zc3h12bG3X9I7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zc3h12bG3X9I7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zc3h12bG3X9I7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zc3h12bG3X9I7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zc3h12bG3X9I7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zc3h12bG3X9I7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zc3h12bG3X9I7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zc3h12bG3X9I7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zc3h12bG3X9I7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zc3h12bG3X9I7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zc3h12bG3X9I7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zc3h12bG3X9I7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zc3h12bG3X9I7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zc3h12bG3X9I7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zc3h12bG3X9I7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zc3h12bG3X9I7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zc3h12bG3X9I7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zc3h12bG3X9I7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zc3h12bG3X9I7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zc3h12bG3X9I7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Zc3h12bG3X9I7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Zc3h12bG3X9I7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zc3h12bG3X9I7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zc3h12bG3X9I7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zc3h12bG3X9I7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zc3h12bG3X9I7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zc3h12bG3X9I7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Zc3h12bG3X9I7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zc3h12bG3X9I7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Zc3h12bG3X9I7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Zc3h12bG3X9I7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zc3h12bG3X9I7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zc3h12bG3X9I7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Zc3h12bG3X9I7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Zc3h12bG3X9I7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Zc3h12bG3X9I7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zc3h12bG3X9I7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zc3h12bG3X9I7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zc3h12bG3X9I7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zc3h12bG3X9I7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zc3h12bG3X9I7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zc3h12bG3X9I7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zc3h12bG3X9I7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Zc3h12bG3X9I7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zc3h12bG3X9I7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Zc3h12bG3X9I7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zc3h12bG3X9I7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zc3h12bG3X9I7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zc3h12bG3X9I7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zc3h12bG3X9I7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zc3h12bG3X9I7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms