Protein–RNA interactions for Protein: F6ZNL5

Pcdh11x, Protocadherin 11 X-linked, mousemouse

Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh11xF6ZNL5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pcdh11xF6ZNL5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pcdh11xF6ZNL5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcdh11xF6ZNL5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Pcdh11xF6ZNL5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcdh11xF6ZNL5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcdh11xF6ZNL5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcdh11xF6ZNL5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Pcdh11xF6ZNL5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pcdh11xF6ZNL5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pcdh11xF6ZNL5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pcdh11xF6ZNL5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pcdh11xF6ZNL5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pcdh11xF6ZNL5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pcdh11xF6ZNL5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcdh11xF6ZNL5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pcdh11xF6ZNL5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pcdh11xF6ZNL5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pcdh11xF6ZNL5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pcdh11xF6ZNL5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pcdh11xF6ZNL5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pcdh11xF6ZNL5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcdh11xF6ZNL5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pcdh11xF6ZNL5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pcdh11xF6ZNL5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pcdh11xF6ZNL5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pcdh11xF6ZNL5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pcdh11xF6ZNL5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pcdh11xF6ZNL5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pcdh11xF6ZNL5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcdh11xF6ZNL5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcdh11xF6ZNL5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Pcdh11xF6ZNL5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcdh11xF6ZNL5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pcdh11xF6ZNL5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh11xF6ZNL5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh11xF6ZNL5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pcdh11xF6ZNL5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pcdh11xF6ZNL5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcdh11xF6ZNL5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Pcdh11xF6ZNL5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pcdh11xF6ZNL5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcdh11xF6ZNL5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcdh11xF6ZNL5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pcdh11xF6ZNL5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pcdh11xF6ZNL5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pcdh11xF6ZNL5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pcdh11xF6ZNL5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh11xF6ZNL5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh11xF6ZNL5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pcdh11xF6ZNL5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcdh11xF6ZNL5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pcdh11xF6ZNL5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcdh11xF6ZNL5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcdh11xF6ZNL5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcdh11xF6ZNL5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcdh11xF6ZNL5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcdh11xF6ZNL5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcdh11xF6ZNL5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcdh11xF6ZNL5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcdh11xF6ZNL5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcdh11xF6ZNL5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcdh11xF6ZNL5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcdh11xF6ZNL5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcdh11xF6ZNL5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pcdh11xF6ZNL5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh11xF6ZNL5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Pcdh11xF6ZNL5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pcdh11xF6ZNL5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pcdh11xF6ZNL5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pcdh11xF6ZNL5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh11xF6ZNL5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pcdh11xF6ZNL5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh11xF6ZNL5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh11xF6ZNL5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pcdh11xF6ZNL5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pcdh11xF6ZNL5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pcdh11xF6ZNL5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcdh11xF6ZNL5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms