Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Pdzd7E9Q9W7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Pdzd7E9Q9W7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Pdzd7E9Q9W7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Pdzd7E9Q9W7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Pdzd7E9Q9W7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Pdzd7E9Q9W7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Pdzd7E9Q9W7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Pdzd7E9Q9W7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Pdzd7E9Q9W7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
Pdzd7E9Q9W7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Pdzd7E9Q9W7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
Pdzd7E9Q9W7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Pdzd7E9Q9W7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Pdzd7E9Q9W7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Pdzd7E9Q9W7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Pdzd7E9Q9W7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Pdzd7E9Q9W7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Pdzd7E9Q9W7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Pdzd7E9Q9W7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Pdzd7E9Q9W7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Pdzd7E9Q9W7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,09■■□□□ 1,77
Pdzd7E9Q9W7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Pdzd7E9Q9W7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Pdzd7E9Q9W7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Pdzd7E9Q9W7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Pdzd7E9Q9W7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Pdzd7E9Q9W7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Pdzd7E9Q9W7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,92■■□□□ 1,74
Pdzd7E9Q9W7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Pdzd7E9Q9W7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Pdzd7E9Q9W7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Pdzd7E9Q9W7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Pdzd7E9Q9W7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Pdzd7E9Q9W7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Pdzd7E9Q9W7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Pdzd7E9Q9W7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Pdzd7E9Q9W7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Pdzd7E9Q9W7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Pdzd7E9Q9W7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Pdzd7E9Q9W7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Pdzd7E9Q9W7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Pdzd7E9Q9W7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Pdzd7E9Q9W7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Pdzd7E9Q9W7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Pdzd7E9Q9W7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Pdzd7E9Q9W7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Pdzd7E9Q9W7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Pdzd7E9Q9W7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Pdzd7E9Q9W7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Pdzd7E9Q9W7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Pdzd7E9Q9W7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Pdzd7E9Q9W7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Pdzd7E9Q9W7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Pdzd7E9Q9W7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Pdzd7E9Q9W7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,73■■□□□ 1,71
Pdzd7E9Q9W7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Pdzd7E9Q9W7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Pdzd7E9Q9W7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Pdzd7E9Q9W7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Pdzd7E9Q9W7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Pdzd7E9Q9W7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Pdzd7E9Q9W7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Pdzd7E9Q9W7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Pdzd7E9Q9W7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Pdzd7E9Q9W7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Pdzd7E9Q9W7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Pdzd7E9Q9W7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
Pdzd7E9Q9W7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Pdzd7E9Q9W7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,63■■□□□ 1,69
Pdzd7E9Q9W7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Pdzd7E9Q9W7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Pdzd7E9Q9W7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Pdzd7E9Q9W7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Pdzd7E9Q9W7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,6 ms