Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W4

Slc27a6, Solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 6, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a6E9Q9W4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc27a6E9Q9W4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc27a6E9Q9W4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a6E9Q9W4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a6E9Q9W4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a6E9Q9W4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc27a6E9Q9W4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a6E9Q9W4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a6E9Q9W4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc27a6E9Q9W4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc27a6E9Q9W4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a6E9Q9W4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc27a6E9Q9W4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc27a6E9Q9W4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc27a6E9Q9W4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc27a6E9Q9W4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc27a6E9Q9W4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc27a6E9Q9W4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc27a6E9Q9W4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc27a6E9Q9W4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a6E9Q9W4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc27a6E9Q9W4 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a6E9Q9W4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a6E9Q9W4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc27a6E9Q9W4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc27a6E9Q9W4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc27a6E9Q9W4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc27a6E9Q9W4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc27a6E9Q9W4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc27a6E9Q9W4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc27a6E9Q9W4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc27a6E9Q9W4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc27a6E9Q9W4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc27a6E9Q9W4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc27a6E9Q9W4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc27a6E9Q9W4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc27a6E9Q9W4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc27a6E9Q9W4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc27a6E9Q9W4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc27a6E9Q9W4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc27a6E9Q9W4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc27a6E9Q9W4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc27a6E9Q9W4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc27a6E9Q9W4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc27a6E9Q9W4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc27a6E9Q9W4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc27a6E9Q9W4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc27a6E9Q9W4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc27a6E9Q9W4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc27a6E9Q9W4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a6E9Q9W4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc27a6E9Q9W4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc27a6E9Q9W4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slc27a6E9Q9W4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc27a6E9Q9W4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc27a6E9Q9W4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc27a6E9Q9W4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc27a6E9Q9W4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc27a6E9Q9W4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc27a6E9Q9W4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc27a6E9Q9W4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc27a6E9Q9W4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc27a6E9Q9W4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc27a6E9Q9W4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms