Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn2r35E9Q7U8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vmn2r35E9Q7U8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vmn2r35E9Q7U8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vmn2r35E9Q7U8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vmn2r35E9Q7U8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn2r35E9Q7U8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vmn2r35E9Q7U8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn2r35E9Q7U8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn2r35E9Q7U8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn2r35E9Q7U8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Vmn2r35E9Q7U8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vmn2r35E9Q7U8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Vmn2r35E9Q7U8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn2r35E9Q7U8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vmn2r35E9Q7U8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn2r35E9Q7U8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vmn2r35E9Q7U8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vmn2r35E9Q7U8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vmn2r35E9Q7U8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r35E9Q7U8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Vmn2r35E9Q7U8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r35E9Q7U8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r35E9Q7U8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vmn2r35E9Q7U8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn2r35E9Q7U8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Vmn2r35E9Q7U8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn2r35E9Q7U8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vmn2r35E9Q7U8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vmn2r35E9Q7U8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn2r35E9Q7U8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vmn2r35E9Q7U8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vmn2r35E9Q7U8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r35E9Q7U8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vmn2r35E9Q7U8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vmn2r35E9Q7U8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r35E9Q7U8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vmn2r35E9Q7U8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r35E9Q7U8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vmn2r35E9Q7U8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vmn2r35E9Q7U8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Vmn2r35E9Q7U8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r35E9Q7U8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vmn2r35E9Q7U8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Vmn2r35E9Q7U8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vmn2r35E9Q7U8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vmn2r35E9Q7U8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r35E9Q7U8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r35E9Q7U8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vmn2r35E9Q7U8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r35E9Q7U8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vmn2r35E9Q7U8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vmn2r35E9Q7U8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vmn2r35E9Q7U8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vmn2r35E9Q7U8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vmn2r35E9Q7U8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vmn2r35E9Q7U8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vmn2r35E9Q7U8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vmn2r35E9Q7U8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn2r35E9Q7U8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vmn2r35E9Q7U8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn2r35E9Q7U8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn2r35E9Q7U8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vmn2r35E9Q7U8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn2r35E9Q7U8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vmn2r35E9Q7U8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vmn2r35E9Q7U8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vmn2r35E9Q7U8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms