Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5D8

Vmn2r48, Vomeronasal 2, receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r48E9Q5D8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r48E9Q5D8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r48E9Q5D8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn2r48E9Q5D8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vmn2r48E9Q5D8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn2r48E9Q5D8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r48E9Q5D8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r48E9Q5D8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r48E9Q5D8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r48E9Q5D8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r48E9Q5D8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r48E9Q5D8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r48E9Q5D8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r48E9Q5D8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn2r48E9Q5D8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r48E9Q5D8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r48E9Q5D8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r48E9Q5D8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r48E9Q5D8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn2r48E9Q5D8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn2r48E9Q5D8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r48E9Q5D8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r48E9Q5D8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r48E9Q5D8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r48E9Q5D8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn2r48E9Q5D8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn2r48E9Q5D8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r48E9Q5D8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r48E9Q5D8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r48E9Q5D8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r48E9Q5D8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r48E9Q5D8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r48E9Q5D8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r48E9Q5D8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r48E9Q5D8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r48E9Q5D8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r48E9Q5D8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn2r48E9Q5D8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r48E9Q5D8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r48E9Q5D8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r48E9Q5D8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn2r48E9Q5D8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r48E9Q5D8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r48E9Q5D8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r48E9Q5D8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r48E9Q5D8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r48E9Q5D8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r48E9Q5D8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r48E9Q5D8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r48E9Q5D8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn2r48E9Q5D8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn2r48E9Q5D8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r48E9Q5D8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r48E9Q5D8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn2r48E9Q5D8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r48E9Q5D8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn2r48E9Q5D8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r48E9Q5D8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r48E9Q5D8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn2r48E9Q5D8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn2r48E9Q5D8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn2r48E9Q5D8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn2r48E9Q5D8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn2r48E9Q5D8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn2r48E9Q5D8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r48E9Q5D8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r48E9Q5D8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn2r48E9Q5D8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r48E9Q5D8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn2r48E9Q5D8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vmn2r48E9Q5D8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r48E9Q5D8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vmn2r48E9Q5D8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r48E9Q5D8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vmn2r48E9Q5D8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r48E9Q5D8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vmn2r48E9Q5D8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vmn2r48E9Q5D8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r48E9Q5D8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vmn2r48E9Q5D8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r48E9Q5D8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmn2r48E9Q5D8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vmn2r48E9Q5D8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r48E9Q5D8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r48E9Q5D8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r48E9Q5D8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r48E9Q5D8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vmn2r48E9Q5D8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vmn2r48E9Q5D8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vmn2r48E9Q5D8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms