Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Krtap11-1E9Q2E9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krtap11-1E9Q2E9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Krtap11-1E9Q2E9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Krtap11-1E9Q2E9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Krtap11-1E9Q2E9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Krtap11-1E9Q2E9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Krtap11-1E9Q2E9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Krtap11-1E9Q2E9 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Krtap11-1E9Q2E9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krtap11-1E9Q2E9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Krtap11-1E9Q2E9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krtap11-1E9Q2E9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krtap11-1E9Q2E9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Krtap11-1E9Q2E9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krtap11-1E9Q2E9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krtap11-1E9Q2E9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krtap11-1E9Q2E9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krtap11-1E9Q2E9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krtap11-1E9Q2E9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krtap11-1E9Q2E9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krtap11-1E9Q2E9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krtap11-1E9Q2E9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Krtap11-1E9Q2E9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Krtap11-1E9Q2E9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krtap11-1E9Q2E9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krtap11-1E9Q2E9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Krtap11-1E9Q2E9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krtap11-1E9Q2E9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Krtap11-1E9Q2E9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms