Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0N2

Ptprh, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprhE9Q0N2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprhE9Q0N2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprhE9Q0N2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtprhE9Q0N2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PtprhE9Q0N2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PtprhE9Q0N2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PtprhE9Q0N2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PtprhE9Q0N2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PtprhE9Q0N2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprhE9Q0N2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PtprhE9Q0N2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PtprhE9Q0N2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PtprhE9Q0N2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PtprhE9Q0N2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprhE9Q0N2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtprhE9Q0N2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtprhE9Q0N2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprhE9Q0N2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtprhE9Q0N2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprhE9Q0N2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtprhE9Q0N2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtprhE9Q0N2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtprhE9Q0N2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprhE9Q0N2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PtprhE9Q0N2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PtprhE9Q0N2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PtprhE9Q0N2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprhE9Q0N2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PtprhE9Q0N2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PtprhE9Q0N2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PtprhE9Q0N2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PtprhE9Q0N2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PtprhE9Q0N2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprhE9Q0N2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PtprhE9Q0N2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PtprhE9Q0N2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PtprhE9Q0N2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprhE9Q0N2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprhE9Q0N2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PtprhE9Q0N2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PtprhE9Q0N2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprhE9Q0N2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprhE9Q0N2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprhE9Q0N2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprhE9Q0N2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprhE9Q0N2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprhE9Q0N2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprhE9Q0N2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprhE9Q0N2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprhE9Q0N2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprhE9Q0N2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms