Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gcom1E9PZ54 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gcom1E9PZ54 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gcom1E9PZ54 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gcom1E9PZ54 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gcom1E9PZ54 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gcom1E9PZ54 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gcom1E9PZ54 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gcom1E9PZ54 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gcom1E9PZ54 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gcom1E9PZ54 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gcom1E9PZ54 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Gcom1E9PZ54 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gcom1E9PZ54 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gcom1E9PZ54 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gcom1E9PZ54 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gcom1E9PZ54 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gcom1E9PZ54 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gcom1E9PZ54 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gcom1E9PZ54 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gcom1E9PZ54 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Gcom1E9PZ54 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gcom1E9PZ54 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gcom1E9PZ54 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Gcom1E9PZ54 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gcom1E9PZ54 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Gcom1E9PZ54 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gcom1E9PZ54 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gcom1E9PZ54 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Gcom1E9PZ54 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gcom1E9PZ54 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gcom1E9PZ54 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gcom1E9PZ54 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Gcom1E9PZ54 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gcom1E9PZ54 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Gcom1E9PZ54 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gcom1E9PZ54 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gcom1E9PZ54 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Gcom1E9PZ54 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gcom1E9PZ54 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gcom1E9PZ54 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gcom1E9PZ54 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gcom1E9PZ54 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gcom1E9PZ54 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gcom1E9PZ54 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gcom1E9PZ54 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gcom1E9PZ54 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gcom1E9PZ54 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gcom1E9PZ54 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gcom1E9PZ54 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gcom1E9PZ54 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gcom1E9PZ54 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gcom1E9PZ54 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gcom1E9PZ54 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gcom1E9PZ54 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gcom1E9PZ54 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gcom1E9PZ54 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gcom1E9PZ54 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Gcom1E9PZ54 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gcom1E9PZ54 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gcom1E9PZ54 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gcom1E9PZ54 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gcom1E9PZ54 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gcom1E9PZ54 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gcom1E9PZ54 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gcom1E9PZ54 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gcom1E9PZ54 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gcom1E9PZ54 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Gcom1E9PZ54 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gcom1E9PZ54 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcom1E9PZ54 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gcom1E9PZ54 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcom1E9PZ54 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gcom1E9PZ54 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcom1E9PZ54 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gcom1E9PZ54 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcom1E9PZ54 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gcom1E9PZ54 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gcom1E9PZ54 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Gcom1E9PZ54 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gcom1E9PZ54 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcom1E9PZ54 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gcom1E9PZ54 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gcom1E9PZ54 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gcom1E9PZ54 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Gcom1E9PZ54 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gcom1E9PZ54 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gcom1E9PZ54 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gcom1E9PZ54 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gcom1E9PZ54 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gcom1E9PZ54 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gcom1E9PZ54 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gcom1E9PZ54 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gcom1E9PZ54 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcom1E9PZ54 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gcom1E9PZ54 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gcom1E9PZ54 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gcom1E9PZ54 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gcom1E9PZ54 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gcom1E9PZ54 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms