Protein–RNA interactions for Protein: E9PYW5

Vmn1r174, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r174E9PYW5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vmn1r174E9PYW5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r174E9PYW5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r174E9PYW5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r174E9PYW5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r174E9PYW5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r174E9PYW5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r174E9PYW5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r174E9PYW5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r174E9PYW5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r174E9PYW5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r174E9PYW5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r174E9PYW5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vmn1r174E9PYW5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r174E9PYW5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r174E9PYW5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r174E9PYW5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vmn1r174E9PYW5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r174E9PYW5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r174E9PYW5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Vmn1r174E9PYW5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r174E9PYW5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r174E9PYW5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r174E9PYW5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r174E9PYW5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r174E9PYW5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r174E9PYW5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r174E9PYW5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r174E9PYW5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r174E9PYW5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r174E9PYW5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r174E9PYW5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r174E9PYW5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r174E9PYW5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r174E9PYW5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r174E9PYW5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r174E9PYW5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r174E9PYW5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r174E9PYW5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vmn1r174E9PYW5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r174E9PYW5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Vmn1r174E9PYW5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r174E9PYW5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r174E9PYW5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vmn1r174E9PYW5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r174E9PYW5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r174E9PYW5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vmn1r174E9PYW5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vmn1r174E9PYW5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vmn1r174E9PYW5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vmn1r174E9PYW5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r174E9PYW5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vmn1r174E9PYW5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vmn1r174E9PYW5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Vmn1r174E9PYW5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.7 ms