Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc175E9PVB3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc175E9PVB3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc175E9PVB3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc175E9PVB3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc175E9PVB3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc175E9PVB3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc175E9PVB3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc175E9PVB3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc175E9PVB3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc175E9PVB3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc175E9PVB3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc175E9PVB3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc175E9PVB3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc175E9PVB3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc175E9PVB3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc175E9PVB3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc175E9PVB3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc175E9PVB3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc175E9PVB3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc175E9PVB3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ccdc175E9PVB3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc175E9PVB3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc175E9PVB3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc175E9PVB3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc175E9PVB3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc175E9PVB3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc175E9PVB3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc175E9PVB3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc175E9PVB3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc175E9PVB3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc175E9PVB3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc175E9PVB3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc175E9PVB3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc175E9PVB3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc175E9PVB3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc175E9PVB3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc175E9PVB3 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc175E9PVB3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc175E9PVB3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc175E9PVB3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc175E9PVB3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc175E9PVB3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc175E9PVB3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc175E9PVB3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc175E9PVB3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc175E9PVB3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc175E9PVB3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc175E9PVB3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc175E9PVB3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc175E9PVB3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc175E9PVB3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc175E9PVB3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc175E9PVB3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc175E9PVB3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ccdc175E9PVB3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc175E9PVB3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc175E9PVB3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc175E9PVB3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc175E9PVB3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc175E9PVB3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc175E9PVB3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms