Protein–RNA interactions for Protein: E9PUZ0

Apol11b, Apolipoprotein L 11b, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol11bE9PUZ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apol11bE9PUZ0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apol11bE9PUZ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apol11bE9PUZ0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apol11bE9PUZ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apol11bE9PUZ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Apol11bE9PUZ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apol11bE9PUZ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apol11bE9PUZ0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Apol11bE9PUZ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apol11bE9PUZ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Apol11bE9PUZ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Apol11bE9PUZ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Apol11bE9PUZ0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apol11bE9PUZ0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Apol11bE9PUZ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apol11bE9PUZ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apol11bE9PUZ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apol11bE9PUZ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apol11bE9PUZ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apol11bE9PUZ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Apol11bE9PUZ0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Apol11bE9PUZ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Apol11bE9PUZ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol11bE9PUZ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Apol11bE9PUZ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Apol11bE9PUZ0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Apol11bE9PUZ0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol11bE9PUZ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol11bE9PUZ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Apol11bE9PUZ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Apol11bE9PUZ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Apol11bE9PUZ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Apol11bE9PUZ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol11bE9PUZ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol11bE9PUZ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Apol11bE9PUZ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol11bE9PUZ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol11bE9PUZ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Apol11bE9PUZ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Apol11bE9PUZ0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Apol11bE9PUZ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Apol11bE9PUZ0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Apol11bE9PUZ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol11bE9PUZ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol11bE9PUZ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Apol11bE9PUZ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Apol11bE9PUZ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apol11bE9PUZ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Apol11bE9PUZ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol11bE9PUZ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apol11bE9PUZ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Apol11bE9PUZ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol11bE9PUZ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol11bE9PUZ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Apol11bE9PUZ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol11bE9PUZ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apol11bE9PUZ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol11bE9PUZ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apol11bE9PUZ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Apol11bE9PUZ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apol11bE9PUZ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol11bE9PUZ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Apol11bE9PUZ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Apol11bE9PUZ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apol11bE9PUZ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Apol11bE9PUZ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Apol11bE9PUZ0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol11bE9PUZ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apol11bE9PUZ0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol11bE9PUZ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol11bE9PUZ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol11bE9PUZ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apol11bE9PUZ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apol11bE9PUZ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apol11bE9PUZ0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms