Protein–RNA interactions for Protein: E0CYQ0

Kctd17, MCG13350, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd17E0CYQ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,8■■□□□ 1,56
Kctd17E0CYQ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Kctd17E0CYQ0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Kctd17E0CYQ0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Kctd17E0CYQ0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,72■■□□□ 1,55
Kctd17E0CYQ0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Kctd17E0CYQ0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,67■■□□□ 1,54
Kctd17E0CYQ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Kctd17E0CYQ0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Kctd17E0CYQ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Kctd17E0CYQ0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Kctd17E0CYQ0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,63■■□□□ 1,53
Kctd17E0CYQ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Kctd17E0CYQ0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,6■■□□□ 1,53
Kctd17E0CYQ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,59■■□□□ 1,53
Kctd17E0CYQ0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Kctd17E0CYQ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Kctd17E0CYQ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Kctd17E0CYQ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24,55■■□□□ 1,52
Kctd17E0CYQ0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Kctd17E0CYQ0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Kctd17E0CYQ0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Kctd17E0CYQ0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Kctd17E0CYQ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Kctd17E0CYQ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Kctd17E0CYQ0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Kctd17E0CYQ0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Kctd17E0CYQ0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24,47■■□□□ 1,51
Kctd17E0CYQ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,45■■□□□ 1,51
Kctd17E0CYQ0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Kctd17E0CYQ0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Kctd17E0CYQ0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Kctd17E0CYQ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,42■■□□□ 1,5
Kctd17E0CYQ0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,41■■□□□ 1,5
Kctd17E0CYQ0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
Kctd17E0CYQ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,39■■□□□ 1,5
Kctd17E0CYQ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Kctd17E0CYQ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
Kctd17E0CYQ0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Kctd17E0CYQ0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,37■■□□□ 1,49
Kctd17E0CYQ0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Kctd17E0CYQ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Kctd17E0CYQ0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Kctd17E0CYQ0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Kctd17E0CYQ0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,33■■□□□ 1,49
Kctd17E0CYQ0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Kctd17E0CYQ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Kctd17E0CYQ0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Kctd17E0CYQ0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Kctd17E0CYQ0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Kctd17E0CYQ0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Kctd17E0CYQ0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Kctd17E0CYQ0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Kctd17E0CYQ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Kctd17E0CYQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Kctd17E0CYQ0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Kctd17E0CYQ0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,28■■□□□ 1,48
Kctd17E0CYQ0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
Kctd17E0CYQ0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Kctd17E0CYQ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Kctd17E0CYQ0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Kctd17E0CYQ0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Kctd17E0CYQ0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24,25■■□□□ 1,47
Kctd17E0CYQ0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
Kctd17E0CYQ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Kctd17E0CYQ0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Kctd17E0CYQ0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Kctd17E0CYQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Kctd17E0CYQ0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Kctd17E0CYQ0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Kctd17E0CYQ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Kctd17E0CYQ0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Kctd17E0CYQ0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Kctd17E0CYQ0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Kctd17E0CYQ0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Kctd17E0CYQ0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,14■■□□□ 1,45
Kctd17E0CYQ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Kctd17E0CYQ0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Kctd17E0CYQ0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Kctd17E0CYQ0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,13■■□□□ 1,45
Kctd17E0CYQ0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24,12■■□□□ 1,45
Kctd17E0CYQ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Kctd17E0CYQ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Kctd17E0CYQ0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Kctd17E0CYQ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Kctd17E0CYQ0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24,07■■□□□ 1,44
Kctd17E0CYQ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Kctd17E0CYQ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,06■■□□□ 1,44
Kctd17E0CYQ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Kctd17E0CYQ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,05■■□□□ 1,44
Kctd17E0CYQ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,04■■□□□ 1,44
Kctd17E0CYQ0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Kctd17E0CYQ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Kctd17E0CYQ0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24,01■■□□□ 1,43
Kctd17E0CYQ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,99■■□□□ 1,43
Kctd17E0CYQ0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Kctd17E0CYQ0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Kctd17E0CYQ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Kctd17E0CYQ0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23,97■■□□□ 1,43
Kctd17E0CYQ0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29,1 ms