Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC2

Gm28043, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28043E0CXC2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28043E0CXC2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28043E0CXC2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm28043E0CXC2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28043E0CXC2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28043E0CXC2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28043E0CXC2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm28043E0CXC2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28043E0CXC2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm28043E0CXC2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28043E0CXC2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28043E0CXC2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gm28043E0CXC2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gm28043E0CXC2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gm28043E0CXC2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28043E0CXC2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28043E0CXC2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gm28043E0CXC2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28043E0CXC2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gm28043E0CXC2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28043E0CXC2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28043E0CXC2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28043E0CXC2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28043E0CXC2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28043E0CXC2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gm28043E0CXC2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gm28043E0CXC2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm28043E0CXC2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28043E0CXC2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28043E0CXC2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28043E0CXC2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28043E0CXC2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28043E0CXC2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28043E0CXC2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28043E0CXC2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28043E0CXC2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28043E0CXC2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28043E0CXC2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28043E0CXC2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28043E0CXC2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28043E0CXC2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28043E0CXC2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28043E0CXC2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28043E0CXC2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28043E0CXC2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28043E0CXC2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28043E0CXC2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28043E0CXC2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28043E0CXC2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28043E0CXC2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28043E0CXC2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28043E0CXC2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28043E0CXC2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28043E0CXC2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm28043E0CXC2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gm28043E0CXC2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28043E0CXC2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28043E0CXC2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28043E0CXC2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28043E0CXC2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28043E0CXC2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28043E0CXC2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28043E0CXC2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm28043E0CXC2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Gm28043E0CXC2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28043E0CXC2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28043E0CXC2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28043E0CXC2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28043E0CXC2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28043E0CXC2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gm28043E0CXC2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28043E0CXC2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28043E0CXC2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm28043E0CXC2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28043E0CXC2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28043E0CXC2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm28043E0CXC2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28043E0CXC2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28043E0CXC2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28043E0CXC2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28043E0CXC2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28043E0CXC2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28043E0CXC2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28043E0CXC2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28043E0CXC2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28043E0CXC2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28043E0CXC2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28043E0CXC2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28043E0CXC2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms