Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vpreb3D3Z6J4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vpreb3D3Z6J4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vpreb3D3Z6J4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vpreb3D3Z6J4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vpreb3D3Z6J4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vpreb3D3Z6J4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vpreb3D3Z6J4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vpreb3D3Z6J4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vpreb3D3Z6J4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vpreb3D3Z6J4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vpreb3D3Z6J4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vpreb3D3Z6J4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vpreb3D3Z6J4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vpreb3D3Z6J4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb3D3Z6J4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vpreb3D3Z6J4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vpreb3D3Z6J4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vpreb3D3Z6J4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vpreb3D3Z6J4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vpreb3D3Z6J4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vpreb3D3Z6J4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vpreb3D3Z6J4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vpreb3D3Z6J4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vpreb3D3Z6J4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vpreb3D3Z6J4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms