Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zfc3h1B2RT41 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zfc3h1B2RT41 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Zfc3h1B2RT41 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zfc3h1B2RT41 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfc3h1B2RT41 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zfc3h1B2RT41 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zfc3h1B2RT41 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zfc3h1B2RT41 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zfc3h1B2RT41 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Zfc3h1B2RT41 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Zfc3h1B2RT41 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Zfc3h1B2RT41 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Zfc3h1B2RT41 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Zfc3h1B2RT41 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfc3h1B2RT41 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Zfc3h1B2RT41 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Zfc3h1B2RT41 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Zfc3h1B2RT41 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfc3h1B2RT41 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfc3h1B2RT41 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Zfc3h1B2RT41 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Zfc3h1B2RT41 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Zfc3h1B2RT41 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfc3h1B2RT41 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Zfc3h1B2RT41 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Zfc3h1B2RT41 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zfc3h1B2RT41 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfc3h1B2RT41 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Zfc3h1B2RT41 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfc3h1B2RT41 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zfc3h1B2RT41 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zfc3h1B2RT41 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zfc3h1B2RT41 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfc3h1B2RT41 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfc3h1B2RT41 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Zfc3h1B2RT41 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfc3h1B2RT41 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfc3h1B2RT41 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zfc3h1B2RT41 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zfc3h1B2RT41 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfc3h1B2RT41 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfc3h1B2RT41 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zfc3h1B2RT41 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zfc3h1B2RT41 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Zfc3h1B2RT41 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Zfc3h1B2RT41 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfc3h1B2RT41 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Zfc3h1B2RT41 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zfc3h1B2RT41 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Zfc3h1B2RT41 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Zfc3h1B2RT41 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Zfc3h1B2RT41 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Zfc3h1B2RT41 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Zfc3h1B2RT41 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Zfc3h1B2RT41 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Zfc3h1B2RT41 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zfc3h1B2RT41 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Zfc3h1B2RT41 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Zfc3h1B2RT41 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Zfc3h1B2RT41 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Zfc3h1B2RT41 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Zfc3h1B2RT41 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfc3h1B2RT41 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zfc3h1B2RT41 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zfc3h1B2RT41 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfc3h1B2RT41 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfc3h1B2RT41 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfc3h1B2RT41 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfc3h1B2RT41 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfc3h1B2RT41 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfc3h1B2RT41 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfc3h1B2RT41 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfc3h1B2RT41 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zfc3h1B2RT41 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zfc3h1B2RT41 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfc3h1B2RT41 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Zfc3h1B2RT41 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms