Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YU88

Gm3147, Predicted gene 3147, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3147A0A0J9YU88 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm3147A0A0J9YU88 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm3147A0A0J9YU88 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm3147A0A0J9YU88 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm3147A0A0J9YU88 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3147A0A0J9YU88 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3147A0A0J9YU88 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3147A0A0J9YU88 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3147A0A0J9YU88 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3147A0A0J9YU88 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3147A0A0J9YU88 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3147A0A0J9YU88 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3147A0A0J9YU88 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3147A0A0J9YU88 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm3147A0A0J9YU88 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3147A0A0J9YU88 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3147A0A0J9YU88 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm3147A0A0J9YU88 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3147A0A0J9YU88 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3147A0A0J9YU88 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3147A0A0J9YU88 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3147A0A0J9YU88 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3147A0A0J9YU88 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3147A0A0J9YU88 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3147A0A0J9YU88 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3147A0A0J9YU88 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm3147A0A0J9YU88 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3147A0A0J9YU88 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3147A0A0J9YU88 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3147A0A0J9YU88 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3147A0A0J9YU88 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3147A0A0J9YU88 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3147A0A0J9YU88 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3147A0A0J9YU88 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3147A0A0J9YU88 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3147A0A0J9YU88 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3147A0A0J9YU88 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3147A0A0J9YU88 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3147A0A0J9YU88 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3147A0A0J9YU88 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3147A0A0J9YU88 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3147A0A0J9YU88 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3147A0A0J9YU88 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3147A0A0J9YU88 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3147A0A0J9YU88 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3147A0A0J9YU88 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3147A0A0J9YU88 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3147A0A0J9YU88 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3147A0A0J9YU88 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gm3147A0A0J9YU88 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gm3147A0A0J9YU88 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3147A0A0J9YU88 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3147A0A0J9YU88 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gm3147A0A0J9YU88 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gm3147A0A0J9YU88 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3147A0A0J9YU88 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gm3147A0A0J9YU88 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3147A0A0J9YU88 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3147A0A0J9YU88 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gm3147A0A0J9YU88 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3147A0A0J9YU88 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gm3147A0A0J9YU88 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3147A0A0J9YU88 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gm3147A0A0J9YU88 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3147A0A0J9YU88 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gm3147A0A0J9YU88 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm3147A0A0J9YU88 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm3147A0A0J9YU88 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm3147A0A0J9YU88 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3147A0A0J9YU88 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3147A0A0J9YU88 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3147A0A0J9YU88 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm3147A0A0J9YU88 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm3147A0A0J9YU88 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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