Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WNP1

Gm28168, Predicted gene 28168, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28168A0A087WNP1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gm28168A0A087WNP1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28168A0A087WNP1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gm28168A0A087WNP1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gm28168A0A087WNP1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28168A0A087WNP1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Gm28168A0A087WNP1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gm28168A0A087WNP1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28168A0A087WNP1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28168A0A087WNP1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28168A0A087WNP1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28168A0A087WNP1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28168A0A087WNP1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28168A0A087WNP1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28168A0A087WNP1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28168A0A087WNP1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28168A0A087WNP1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28168A0A087WNP1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28168A0A087WNP1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28168A0A087WNP1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28168A0A087WNP1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28168A0A087WNP1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28168A0A087WNP1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28168A0A087WNP1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28168A0A087WNP1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28168A0A087WNP1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28168A0A087WNP1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28168A0A087WNP1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28168A0A087WNP1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28168A0A087WNP1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28168A0A087WNP1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28168A0A087WNP1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28168A0A087WNP1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28168A0A087WNP1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28168A0A087WNP1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28168A0A087WNP1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28168A0A087WNP1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28168A0A087WNP1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gm28168A0A087WNP1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gm28168A0A087WNP1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gm28168A0A087WNP1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gm28168A0A087WNP1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28168A0A087WNP1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gm28168A0A087WNP1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gm28168A0A087WNP1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28168A0A087WNP1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gm28168A0A087WNP1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28168A0A087WNP1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm28168A0A087WNP1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm28168A0A087WNP1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28168A0A087WNP1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm28168A0A087WNP1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28168A0A087WNP1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm28168A0A087WNP1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm28168A0A087WNP1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28168A0A087WNP1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28168A0A087WNP1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm28168A0A087WNP1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm28168A0A087WNP1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gm28168A0A087WNP1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gm28168A0A087WNP1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm28168A0A087WNP1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gm28168A0A087WNP1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28168A0A087WNP1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28168A0A087WNP1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm28168A0A087WNP1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28168A0A087WNP1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm28168A0A087WNP1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm28168A0A087WNP1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gm28168A0A087WNP1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm28168A0A087WNP1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm28168A0A087WNP1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm28168A0A087WNP1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28168A0A087WNP1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm28168A0A087WNP1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm28168A0A087WNP1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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