Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CCDC88CQ9P219 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CCDC88CQ9P219 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms